本發(fā)明屬于生物醫(yī)藥,具體涉及檢測tcf7l2基因snp位點rs11196224的試劑在制備用于個體腦卒中患病風(fēng)險預(yù)測產(chǎn)品中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、腦卒中是指中樞神經(jīng)系統(tǒng)血管損傷引起的急性、局灶性神經(jīng)功能缺損。根據(jù)病理機(jī)制,腦卒中可分為腦梗死、腦出血和蛛網(wǎng)膜下腔出血三種類型。腦卒中作為全球范圍內(nèi)致殘和致死的主要原因之一,具有高發(fā)病率、高致率和高死亡率三大特征。研究表明,wnt/β-catenin?信號傳導(dǎo)對血腦屏障、血視網(wǎng)膜屏障功能和中樞神經(jīng)系統(tǒng)血管生成具有重要的調(diào)節(jié)作用。在成人大腦皮層中,星形膠質(zhì)細(xì)胞、少突膠質(zhì)細(xì)胞和神經(jīng)元主要分泌wnt7a/7b。wnt配體通過與frizzled受體或lrp5/6共受體結(jié)合,從而啟動β-catenin信號傳導(dǎo)。隨后,axin依賴的降解途徑被抑制,促使β-catenin發(fā)生核轉(zhuǎn)位與lef/tcf轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合并激活下游靶基因轉(zhuǎn)錄。wnt/β-catenin?信號傳導(dǎo)的藥理學(xué)抑制導(dǎo)致血腦屏障緊密連接蛋白表達(dá)降低并加重小鼠腦卒中損傷。相比之下,wnt/β-catenin?信號傳導(dǎo)的激活減少血腦屏障破壞和出血缺損減輕腦卒中損傷。因此,wnt/β-catenin?信號轉(zhuǎn)導(dǎo)在腦卒中的疾病發(fā)展中具有重要作用。
2、轉(zhuǎn)錄因子-7like-2(transcription?factor?7-like?2,tcf7l2)是在少突膠質(zhì)細(xì)胞中瞬時誘導(dǎo)的wnt效應(yīng)因子,在大腦發(fā)育中起著重要作用,包括促進(jìn)放射狀膠質(zhì)細(xì)胞的增殖、驅(qū)動少突膠質(zhì)細(xì)胞成熟和調(diào)節(jié)丘腦神經(jīng)元的末端選擇。此外,?tcf7l2通過上調(diào)?usp20抑制氧葡萄糖剝奪/再灌注誘導(dǎo)大鼠細(xì)胞損傷和神經(jīng)功能受損。在大腦中動脈閉塞大鼠模型中,臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞衍生的外泌體通過促進(jìn)?β-catenin?核轉(zhuǎn)位激活?tcf7l2/usp20通路并抑制細(xì)胞凋亡,緩解缺血性腦卒中。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的在于為個體腦卒中患病風(fēng)險預(yù)測提供一種新的生物標(biāo)志物tcf7l2基因snp位點rs11196224,在所述rs11196224位點的c突變?yōu)?t時,個體腦卒中患病風(fēng)險降低,為個體腦卒中患病風(fēng)險預(yù)測提供了新途徑。
2、為了實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供檢測tcf7l2基因snp位點rs11196224的試劑在制備用于個體腦卒中患病風(fēng)險預(yù)測產(chǎn)品中的應(yīng)用,所述rs11196224位點的c>t堿基類型能預(yù)測腦卒中患病風(fēng)險降低。
3、在一種具體的實施方式中,野生基因型cc為風(fēng)險基因型,突變純合基因型tt為有益基因型。
4、在一種具體的實施方式中,所述個體為中國漢族人。
5、在一種具體的實施方式中,所述產(chǎn)品為試劑盒。
6、在一種具體的實施方式中,檢測試劑包括用于檢測所述個體的tcf7l2rs11196224位點的基因型的試劑,所述個體的檢測樣本為個體的dna。
7、在一種具體的實施方式中,所述檢測試劑還包括用于pcr擴(kuò)增的引物對,其中,上游引物的序列如seq?id?no.1所示,下游引物序列如seq?id?no.2所示。
8、在一種具體的實施方式中,所述檢測試劑還包括用于檢測所述個體的丘腦組織中habp2基因的表達(dá)水平的試劑。
9、在一種具體的實施方式中,在所述個體的丘腦組織中habp2基因的表達(dá)水平呈低表達(dá)時,預(yù)測所述個體腦卒中患病風(fēng)險降低。
10、本發(fā)明的有益效果至少包括:
11、一、本發(fā)明采用全基因策略研究挖掘tcf7l2基因相關(guān)的多態(tài)性,發(fā)現(xiàn)tcf7l2rs11196224(c>t)與腦卒中的患病風(fēng)險具有顯著相關(guān)性,在tcf7l2?rs11196224位點的野生基因型cc突變?yōu)殡s合基因型ct和純合基因型tt時,個體患腦卒中的患病風(fēng)險分別降低34%和64%,表明c是風(fēng)險基因位點,t是有益基因位點,這樣,通過檢測試劑檢測個體的tcf7l2rs11196224位點的基因型,能夠?qū)崿F(xiàn)對腦卒中患病風(fēng)險的早期評估,從而實現(xiàn)對腦卒中人群的早期、快速、準(zhǔn)確、規(guī)?;暮Y查。
12、二、本發(fā)明通過將檢測個體的tcf7l2?rs11196224位點的基因型的檢測試劑應(yīng)用于試劑盒中,能夠快速篩查腦卒中人群,這樣,可以在早期進(jìn)行干預(yù)以降低腦卒中患病風(fēng)險。
13、三、本發(fā)明未發(fā)現(xiàn)腦組織中的rs11196224的基因型與tcf7l2的表達(dá)水平顯著相關(guān),進(jìn)一步對臨近基因adrb1、casp7和habp2進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)丘腦組織中rs11196224基因型與habp2的表達(dá)水平顯著相關(guān),這樣,可以通過檢測丘腦組織中habp2基因的表達(dá)水平來預(yù)測個體腦卒中的患病風(fēng)險。
1.檢測tcf7l2基因snp位點rs11196224的試劑在制備用于個體腦卒中患病風(fēng)險預(yù)測產(chǎn)品中的應(yīng)用,其特征在于,所述rs11196224位點的c>t堿基類型能預(yù)測腦卒中患病風(fēng)險降低。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用,其特征在于,野生基因型cc為風(fēng)險基因型,突變純合基因型tt為有益基因型。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用,其特征在于,所述個體為中國漢族人。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用,其特征在于,所述產(chǎn)品為試劑盒。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用,其特征在于,檢測試劑包括用于檢測所述個體的tcf7l2rs11196224位點的基因型的試劑,所述個體的檢測樣本為個體的dna。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的應(yīng)用,其特征在于,所述檢測試劑還包括用于pcr擴(kuò)增的引物對,其中,上游引物的序列如seq?id?no.1所示,下游引物序列如seq?id?no.2所示。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的應(yīng)用,其特征在于,所述檢測試劑還包括用于檢測所述個體的丘腦組織中habp2基因的表達(dá)水平的試劑。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的應(yīng)用,其特征在于,在所述個體的丘腦組織中habp2基因的表達(dá)水平呈低表達(dá)時,預(yù)測所述個體腦卒中患病風(fēng)險降低。